澎湖的紅土層，依據形成年代，分為古期紅土層與新期紅土層。東衛紅土層屬新期紅土層，分布在東衛至鼎灣、講美一帶，這是玄武岩層頂部之岩石轉變而成。因在更新世時期，特有的氣候溫濕環境下，玄武岩經過深度風化作用發育為紅土。

分布面積雖不是極為廣闊，但棕紅的顏色，卻是非常醒目。由於東衛聚落東邊，海天佛剎東側及北側一帶，土層顏色棕紅，故以「東衛紅土層」為名，以區別漁翁群島中之古期紅土層。